116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5272 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5272  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  347  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  95.38 
 
 		 209 aa  333  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  69.94 
 
 		 204 aa  230  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  64.24 
 
 		 193 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  64.9 
 
 		 193 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 184 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  59.21 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 182 aa  170  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  57.72 
 
 		 191 aa  167  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  60.93 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  55.7 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 200 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 211 aa  84  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
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NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  34.44 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
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NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
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NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  37.58 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
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NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 180 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
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NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  35.14 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  26.32 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  31.87 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  30.86 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 304 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 293 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 304 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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