More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5678 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  66.5 
 
 
193 aa  230  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  65.99 
 
 
193 aa  227  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
192 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 
188 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 
191 aa  139  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  43.07 
 
 
198 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
186 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 
185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
198 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  41.24 
 
 
193 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
194 aa  131  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 
184 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 
194 aa  130  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  39.9 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  41.97 
 
 
203 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 
197 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  42.49 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 
180 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 
205 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
204 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
209 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
200 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 
201 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
198 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 
192 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  41.97 
 
 
196 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 
193 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
221 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
218 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
252 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
180 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 
190 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  37.24 
 
 
180 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 
180 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  36.22 
 
 
186 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  40.43 
 
 
211 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
188 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
194 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 
199 aa  99  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 
197 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
204 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 
199 aa  94.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 
199 aa  88.2  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  35.03 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5272  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  29.38 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.748169 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142024 
 
 
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NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342861 
 
 
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NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  27.87 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
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NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
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