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for query gene Pden_4681 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  50.84 
 
 
186 aa  139  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
193 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
198 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
192 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 
180 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 
191 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  67.16 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  35.63 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  54.88 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
191 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  37.99 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
199 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  60.71 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  60.71 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
199 aa  61.6  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
197 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
179 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.17 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.51 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
179 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 
218 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.42 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.42 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  42.42 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
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NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.426629 
 
 
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