More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2910 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.59 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 228 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  26.49 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  25.67 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
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NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  25.52 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  31.32 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  31.32 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  31.32 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  40.32 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2897  TetR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  31.58 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  29.17 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  31.58 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  29.17 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
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NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
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NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
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