More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5273 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  60.81 
 
 		 254 aa  252  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  57.33 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  56.5 
 
 		 259 aa  244  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  57.21 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 288 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 210 aa  93.2  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 237 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  32.62 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  34.74 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  24.65 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  27.31 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 212 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 209 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 194 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 199 aa  52  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  40.79 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>