More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5563 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  58.33 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  42.72 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  49.3 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  31.79 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  49.3 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 252 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36980  transcriptional regulator  40.16 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  46.77 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 210 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  30.39 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  58.62 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 190 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>