More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6467 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 288 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  42.72 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 259 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 259 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 257 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  40.39 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 290 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 227 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 262 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2813  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  39.47 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 309 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 259 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  28.07 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  39.06 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  23.63 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  29.6 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  35 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>