118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4085 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  53.76 
 
 		 189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 189 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  48.02 
 
 		 189 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 209 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 191 aa  99  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  35.43 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  28.07 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  33.52 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  32.22 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  26.67 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  28.85 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  27.71 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  31.21 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  28.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  27.72 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  28.26 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1790  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  25.73 
 
 		 192 aa  45.4  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29.68 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  27.13 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  49.02 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  28.81 
 
 		 198 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.17 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>