265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0209 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  45.24 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 216 aa  121  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  39.89 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 186 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  28 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  29.79 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  29.09 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  29.87 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 173 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.12 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  34.04 
 
 		 223 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 247 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  30.38 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  43.75 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  26.67 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  34.75 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  33.55 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 299 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  46.27 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  30.54 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 266 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  23.2 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>