97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0495 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  371  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  70.45 
 
 		 180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  68.16 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 193 aa  88.2  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  33.71 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  33.52 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  30.94 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  33.71 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  32.18 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  30.56 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  34.76 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  38.06 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  29.48 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  33.53 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  31.25 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  27.27 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  32.92 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  31.64 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  30.23 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 210 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  26.99 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  31.85 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 226 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  46.97 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  39.06 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  42.37 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 266 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  18.85 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 215 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 199 aa  42  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 219 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 206 aa  42  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3704  regulatory protein TetR  25.14 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  19.88 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  29.85 
 
 		 204 aa  41.6  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 243 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 230 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>