More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2174 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  30.3 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1436  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.940915  normal  0.193535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  26.88 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 317 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  27.37 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5697  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 235 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  23.08 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1477  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 243 aa  48.5  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 291 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  36.54 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33.77 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  21.35 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  40.38 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  41.3 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  31.71 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  22.33 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>