More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0987 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  100 
 
 		 192 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 202 aa  148  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  47.03 
 
 		 194 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11804  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000865181  hitchhiker  0.00796051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 197 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  33.65 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  35.23 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  40.96 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  34.34 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28340  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0595085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  32.59 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.63 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  36.63 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.63 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.63 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.63 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.63 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>