150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4661 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  97.97 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  72.31 
 
 		 206 aa  269  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 203 aa  260  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  53.03 
 
 		 204 aa  205  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 211 aa  197  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 205 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 202 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 202 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 202 aa  174  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 214 aa  154  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 204 aa  117  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  27.84 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  34.65 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 308 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  38.2 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 247 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5811  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  32.69 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  27.86 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 385 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  30.06 
 
 		 232 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 266 aa  45.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  56 
 
 		 243 aa  45.1  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 259 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 770 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  51.16 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 285 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>