30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11804 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11804  transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000865181  hitchhiker  0.00796051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3780  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 197 aa  169  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32.45 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  27.96 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7041  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 233 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03060  transcriptional regulator, tetR family  34.74 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  29.57 
 
 		 232 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>