92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_03060 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_03060  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 247 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  39.76 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 252 aa  94.4  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 236 aa  89  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  27.81 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0133  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  32.65 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  33.01 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  29.92 
 
 		 198 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  25.2 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  46.3 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05630  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 90 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 220 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 204 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 252 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  26.92 
 
 		 248 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 182 aa  41.6  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5133  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  31.82 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  40.26 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 238 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 196 aa  41.6  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 238 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  40.43 
 
 		 238 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  40.43 
 
 		 238 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 238 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 230 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  40.43 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  30.77 
 
 		 183 aa  41.2  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>