More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0227 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 247 aa  487  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  49.4 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 227 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03060  transcriptional regulator, tetR family  39.78 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 199 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  33.73 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  57.41 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  58.14 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  54.76 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 187 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 186 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 192 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 497 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 197 aa  52  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 191 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  25.87 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  41.07 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  45.83 
 
 		 200 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 201 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  53.49 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>