More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3652 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  100 
 
 		 188 aa  364  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  58.02 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  57.61 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  52.43 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  56.22 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  50.84 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  47.28 
 
 		 191 aa  150  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  43.65 
 
 		 192 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  48.9 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  41.1 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 181 aa  97.8  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  30 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  34.78 
 
 		 262 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  27.06 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  31.67 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  57.78 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  29.73 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  46.43 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  32.53 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 252 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  34.09 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>