More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0053 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  30.57 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 289 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 212 aa  52  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 252 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2653  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0164897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  30.56 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  30.99 
 
 		 262 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 237 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>