More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10705 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  69.79 
 
 		 199 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  69.79 
 
 		 199 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  69.79 
 
 		 199 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  66.84 
 
 		 204 aa  259  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  64.77 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  54.86 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  151  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  45.55 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 203 aa  111  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  27.72 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  24.55 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  30.58 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0880  hypothetical protein  29.13 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 497 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 243 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  44.23 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 247 aa  51.6  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 388 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  24.31 
 
 		 181 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  26.53 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 247 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  48.94 
 
 		 390 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>