More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06680 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  53.33 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  29.79 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  24.55 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  41.25 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 246 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  32.06 
 
 		 262 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2820  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.310679  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  35.21 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 71 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3474  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.990992  normal  0.352611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>