More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3667 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  367  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  46.93 
 
 		 190 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 200 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  36.69 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  47.92 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 230 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 251 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 262 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  36.84 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 198 aa  51.2  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.09 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  41.54 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  41.54 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  29.15 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  55.81 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 246 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 246 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 237 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  31.85 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 280 aa  48.1  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>