More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0257 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 183 aa  355  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 190 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  45.3 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 214 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 217 aa  81.3  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  48.42 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  34.86 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  61.22 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.37 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  54.17 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  27.84 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  31.79 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  32.94 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  47.17 
 
 		 248 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 251 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  42 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  42 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 280 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 224 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  37.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  50 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 231 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>