More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3845 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  45.19 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 204 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  29.8 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  31.78 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  22.93 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  27.4 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.51 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  30.7 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13194  TetR/AcrR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.338711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 332 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  27.05 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6808  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  42.59 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>