More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2372 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  95.1  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  30.22 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  36.88 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  32.6 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 212 aa  72  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  33.54 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  27.07 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  31.96 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  33.14 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.94 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  30.86 
 
 		 186 aa  62  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2865  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  30 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  28.4 
 
 		 181 aa  58.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>