More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4242 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2000  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  50.85 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  45.61 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  49.15 
 
 		 262 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
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NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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