More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4404 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  417  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  27.5 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5244  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5332  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.199817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5623  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.63347  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  37.14 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 87 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.54 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.54 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.54 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.54 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.54 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1892  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00216331  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  41.76 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  36.71 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  46.3 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 324 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>