More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0764 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5623  TetR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.63347  normal  0.363092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5244  TetR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5332  TetR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.199817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  42.11 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  37.23 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  23.65 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 246 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  39.34 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 324 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 251 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 325 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0595  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>