More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7250 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 200 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 192 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 209 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 215 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 202 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  60.94 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  41.32 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  29.65 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  32.37 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 191 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  30.65 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  30.99 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 201 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 200 aa  62  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 192 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.78 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3895  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467976  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>