More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4199 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2452  TetR family transcriptional regulator  85.64 
 
 		 228 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  70.94 
 
 		 216 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  70.94 
 
 		 216 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  70.94 
 
 		 216 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 214 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0628  TetR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 63 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.823265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 184 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 204 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 198 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  35.48 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 193 aa  53.5  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 205 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 208 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 228 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 191 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 194 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 195 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 218 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 266 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  38.03 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 196 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 213 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 202 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 206 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 206 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 194 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 205 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 205 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 326 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 184 aa  49.3  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 207 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 205 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 252 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 207 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 205 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 224 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 237 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 197 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  33.33 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  37.8 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>