More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2298 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  397  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  81.77 
 
 		 203 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  84.13 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  54.59 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  59.26 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 198 aa  181  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 191 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 191 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  57.22 
 
 		 191 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  47.85 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5330  transcriptional regulator, TetR family  52.43 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  47.34 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  48.54 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  50.62 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  44.31 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14390  transcriptional regulator, tetR family  41.95 
 
 		 183 aa  108  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  33.52 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  28.42 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  33.09 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  26.22 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1148  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal  0.441003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  51.02 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  32.72 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 194 aa  51.6  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 290 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>