More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0557 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  31.29 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 770 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 240 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 205 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.66 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 188 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 206 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 211 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 209 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  27.72 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  25.85 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  34.21 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 209 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 196 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 207 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 198 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 194 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  28.66 
 
 		 207 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 211 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 453 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 138 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 198 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 209 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 226 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 201 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>