More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5175 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  77.56 
 
 		 217 aa  292  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  58.92 
 
 		 195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  40.5 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  34 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 200 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  38.28 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  52.78 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  28.37 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  28.93 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  27.78 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  67.44 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  30.85 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>