More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2044 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  430  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  77.56 
 
 		 205 aa  289  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  56.52 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  33.99 
 
 		 200 aa  85.1  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 188 aa  85.1  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 257 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  50.68 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  29.53 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  52.46 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  46.43 
 
 		 71 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  29.8 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  29.15 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>