More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2883 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  57.84 
 
 		 205 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  55.88 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 199 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  30.21 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 257 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 252 aa  71.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  47.56 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  41.61 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 280 aa  65.1  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  33.55 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  29.53 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 235 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05630  transcriptional regulator  55.32 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0133922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 212 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>