More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5054 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  48.22 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 289 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 199 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  34.8 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 209 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  43.67 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  33.16 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  38.84 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.77 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  31.01 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  41.32 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  51.47 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  57.78 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  32.76 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  50.88 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  65.96 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  30.73 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  26.04 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  25.59 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>