226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2525 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  390  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  43.3 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  37.77 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  46.28 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  37.67 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 289 aa  71.6  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  52.56 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  35.46 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  47.19 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  47.95 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  35.47 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  50.88 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0193  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  27.88 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  50.88 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  39.51 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>