More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0772 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  48.9 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  47.43 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  47.43 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  47.43 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 211 aa  167  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  42.93 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  48.07 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 226 aa  131  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0880  hypothetical protein  32.62 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.42 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4072  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.860631  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  46.43 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  50.98 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.37 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  40.85 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  29.59 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  47.27 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0243  transcriptional regulator  25.99 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  53.66 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>