More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1155 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  59.65 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  29.72 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  32.72 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  50 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  55.77 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  31.18 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  34.83 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  41.79 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  34.13 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  45.16 
 
 		 71 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  32.79 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>