More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0384 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  85.56 
 
 		 194 aa  317  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  52.66 
 
 		 223 aa  198  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 192 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  52.41 
 
 		 192 aa  191  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 194 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  43.83 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 		 202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  40.84 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  47.47 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  60.32 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  61.67 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  59.02 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  44.09 
 
 		 217 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  53.57 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.54 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  31.43 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  37.78 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  43.96 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  50 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  45.31 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3184  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.13539  normal  0.42811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>