157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0100 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8148  putative transcriptional regulator, TetR family  54.42 
 
 		 221 aa  208  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4392  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  50.69 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  85.1  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  34.09 
 
 		 262 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  21.76 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  21.76 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  21.76 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  21.76 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  23.35 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  23.7 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  23.7 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  27.68 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 394 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 394 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 394 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  32.97 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  41.07 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.59 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 438 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 424 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  48.78 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 424 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  34.83 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>