More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3839 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  60.17 
 
 		 204 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.73 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 197 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  40.65 
 
 		 208 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  34.45 
 
 		 190 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 236 aa  89  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  42.15 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.69 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  39.84 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  37.12 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  45.74 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  33.11 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  34.09 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  34.75 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  37.9 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  32.65 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6361  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 198 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 230 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  49.33 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03060  transcriptional regulator, tetR family  36.44 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  33.61 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  45.59 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 214 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  31.53 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 200 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4864  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>