More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1728 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 215 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 215 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  37.57 
 
 		 248 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  39.55 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  49.38 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  49.32 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  56.06 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  56.9 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  45.24 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  52.56 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.13 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  44.94 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  48.68 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  37.08 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  31.94 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  48.61 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  52.73 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 497 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  44.74 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  30.93 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3202  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.06 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  53.57 
 
 		 71 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>