More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0053 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  31.8 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  41.6 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  39.37 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  55.93 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  41.6 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  48.53 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  46.77 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  49.15 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  34.48 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3987  regulatory protein TetR  47.37 
 
 		 71 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.934886  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 230 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  42.37 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3700  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>