138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0390 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  37.31 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  36.64 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14710  transcriptional regulator, tetR family  35.26 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0751499  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  51.72 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  56.52 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  65.71 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  39.29 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  58.82 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  61.76 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  32.04 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 257 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5077  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 236 aa  45.1  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  55.88 
 
 		 190 aa  45.1  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  57.58 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  32.48 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.37 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>