215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0389 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  33.97 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0267  transcriptional regulator, TetR family  62.5 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614895  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 213 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  45.9 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0772  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  42.11 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  31.41 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  42.86 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 199 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  42.11 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  37.29 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 246 aa  46.2  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  35 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  26.57 
 
 		 248 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>