279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1180 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  77.88 
 
 		 223 aa  317  1e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  31.95 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  44.16 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  52.46 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  49.15 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  48.28 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  27.72 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  46.38 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  44.07 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  44.83 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0267  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614895  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0998  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1016  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.355321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1026  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 199 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  43.08 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1294  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>