189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1602 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  100 
 
 		 216 aa  430  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  37.98 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  52.46 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  29.14 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  50.88 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.5 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 289 aa  52  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06260  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  26.92 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14710  transcriptional regulator, tetR family  36.89 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0751499  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  42.47 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  32.2 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1662  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  0.0656981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  45.61 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0267  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614895  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>