78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2173 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2173  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 200 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0267  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614895  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  34.51 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  46.77 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 289 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  36.78 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  35.37 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  32.43 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 206 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 206 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 217 aa  42  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  42  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27720  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.754006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 191 aa  41.2  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 194 aa  41.2  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>