More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2304 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  43.27 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  33.69 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  58.62 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  61.4 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 280 aa  68.2  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  36.24 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1180  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  31.64 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  48.61 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  45.31 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10705  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0100  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0488762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  43.08 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  69.05 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0786  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000169887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5921  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  32.74 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  53.06 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>