178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2988 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2988  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.399481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4397  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2525  transcriptional regulator, TetR family  37.77 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23360  transcriptional regulator, tetR family  35.15 
 
 		 206 aa  98.2  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.445238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  34.8 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4463  transcriptional regulator, TetR family  41.45 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  40.56 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3143  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1602  regulatory protein TetR  34.48 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5935  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.109466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  33.52 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  37.27 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0716  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 289 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.673391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  42.45 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4988  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4505  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2561  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.0969091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2987  hypothetical protein  29.19 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4515  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0053  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3564  putative transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.394377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  46.05 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1251  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  24.38 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3877  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1438  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.716565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04630  transcriptional regulator, tetR family  30.26 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0384  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 280 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  58.7 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4475  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2833  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0390  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  27.92 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2304  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000274121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3492  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.781193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>